1941-1945:
Am 29. März 1941 erhält Ron das Kapitänspatent für Segelschiffe „auf allen Meeren".

Am 2. Juli 1941 wird er zum Oberleutnant zur See der US-Marine-Reserve ernannt. Mit dem Eintritt der USA in den Zweiten Weltkrieg im Dezember 1941 wird Ron nach Australien beordert, um dort geheimdienstliche Tätigkeiten zu koordinieren.

	Während des Zweiten Weltkriegs diente L. Ron Hubbard als Leutnant in der US-Marine.

Als er im März 1942 in die Vereinigten Staaten zurückkehrt, übernimmt er das Kommando eines Konvoi-Begleitschiffes im Atlantik und später das eines U-Boot-Jägers im Pazifik. Er wird ebenfalls als Ausbilder und Hauptnavigator eingesetzt und dann für die Schule für Militärregierung der Princeton University ausgewählt. Anfang 1945, während Hubbard sich von den Kriegsverletzungen im Oak Knoll Naval Hospital erholt, führt er eine Reihe von Tests und Experimenten am endokrinen System durch. Er entdeckt, ganz im Gegensatz zu bisher vertretenen Ansichten, daß die Funktion die Struktur bestimmt. Mit diesem revolutionären Vorstoß beginnt er, seine Theorien auf das Gebiet des Verstands anzuwenden.

1946:
Nach seiner Entlassung aus der US-Marine im Februar 1946 wendet sich Hubbard wieder dem Schreiben zu, obwohl sein Hauptaugenmerk weiter auf der Entwicklung von Verfahren liegt, die den Zustand des Menschen verbessern sollen. Er schreibt auch weiterhin, um damit diese Forschung unterstützen zu helfen.